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数据库方面论文范文例文,与生物类专业生物信息学教学相关毕业论文范文

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20110;具体的事例,将一系列的知识点有机地串联起来,并通过实例操作达到学以致用的目的.从学生反馈意见可以看出,这种理论与实践结合的教学模式,很好地提高了学生的学习兴趣.考虑到有限的授课时间和不同学生的学习背景,作为教师需要设计合适的案例,从而达到较好的教学效果.一般可以遵循以下原则.

4.1具有代表性

所选的案例既要经典又要紧跟科学前沿.比如第一个案例所蕴含的数据库检索、序列比对和系统进化树的构建,在生物信息学中,属于较经典且核心的知识点.而第二个案例选择的对象则与当前的科研热点紧密联系.


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4.2具有偏向性

生物信息学本身是个交叉学科,涉及的知识点相对较多.面对生物类专业背景的学生,我们侧重生物信息学方法或者工具(软件)的应用,而不是强调算法.比如第一个案例中系统进化树的构建,我们只是以5条8bp长的序列为例讲解最小进化法和邻接法、最大简约法、最大似然法以及贝叶斯推断,重点在于强调不同的数据适合采用上述哪些方法以及如何用Mega等软件实现系统进化树的构建.

4.3先后案例有层次性

比如第一个案例中,学生掌握了Windows下的序列比对.对于第二个案例中Linux下的Bowtie就容易理解并操作.

4.4具有拓展性

比如第一个案例中,在Windows的DOS下进行批量序列比对时,不同的参数设置,输出不同的数据格式.第二个案例中,Bowtie最多允许3个错配,如果允许更多的错配数,则可以采用SOAPaligner/SOAP2实现.学生可以根据自己的兴趣和能力,选择拓展性内容进行继续学习.

4.5良好的成文习惯

引导学生养成良好的文档组织和书写习惯.每一个案例,都要求学生形成可重复性和可复现性的文档,对于整理分析思路、核实结果、重复使用代码都起到事半功倍的效果.

生物信息学是现代生物科学研究的重要工具和载体.如何有效正确地应用生物信息学,是每一个生物实验者需要具备的能力.教师应紧跟学科发展的速度,围绕学以致用的原则,将案例教学科学地、和谐地应用到教学实践中,不仅使学生掌握一定的理论知识,从而正确地应用软件工具,而且逐渐培养学生自我分析和解决问题的能力.

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