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中国农业科学院甘薯研究所为江苏省和中国农业科学院共建所,与成立于1910年的江苏徐淮地区徐州农业科学研究所为同一单位,现与江苏徐州甘薯研究中心、徐州市农业科学院同属一套领导机构,隶属江苏省农业科学院和徐州市人民政府双重领导,接受中国农业科学院的业务指导.下设甘薯品种资源、甘薯遗传育种、甘薯栽培技术、甘薯病虫害防控、甘薯加工利用、小麦育种与栽培、水稻育种与栽培、棉花育种与栽培技术、油料育种与栽培、园艺等11个研究室.还设有办公室、科研处、财务处、后勤服务处与示范基地管理办等5个管理部门以及江苏徐农种业科技有限公司等3个科技企业.
中国农业科学院甘薯研究所所属科研系统分为国家甘薯研究和区域农业研究两部分.国家甘薯研究以应用基础和应用技术研究为主;区域农业研究集应用技术研究、产业开发研究、成果推广应用、科技示范服务等为一体.该所是“七五”、“八五”及“十五”、“十一五”全国农业科研百强单位,在地市级农业科研机构中一直名列前茅.
现有在职职工153人,其中科技人员108人(其中